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肛管后正中部皮肤较固定，直肠末端位置由后方向前弯曲，因此肛门后方承受的压力较大，是肛裂的常见部位。粗暴的检查亦可造成肛裂。肛裂多为单发的纵形、椭园形溃疡，反复损伤、感染，使基底较硬，肉芽灰白，裂下端皮肤因炎症、浅静脉及淋巴回流受阻，发生水肿，形成结缔组织性外痔，称“前哨痔”。肛裂上端肛乳头因炎症和纤维变，成肥大乳头。
肛裂的病因，现在有下列几种说法：
1、解剖上的缺陷学说：肛裂多发生于肛门后位，主要是由于外括约肌浅层在肛管前后方各形成"Y"形薄弱区，耻肛裂结构骨直肠肌又加强肛管两侧的力量。因此肛门后部及前部不如两侧坚强。肛管向下后与直肠后壁形成一角度。排便时，干燥的粪便对肛门后方薄弱区的压力极大，又因肛管之后中线血运差，弹力较少，故造成肛门后方易受伤撕裂。这就是肛裂裂口的位置常发生于后方的原因。
2、感染学说：肛管上端齿线处的特殊结构如肛窦、肛门瓣、肛乳头、肛腺等，容易被干硬的粪团下移时所损伤，使局部产生感染和炎症，或导致肛腺阻塞化脓，溃破后形成肛裂，由于局部炎症刺激，括约肌痉挛，血液供应不足，伤口久不愈合，形成慢性溃疡。
3、括约肌痉挛学说：肛门外括约肌皮下部由于病理性因素，纤维化而失去柔软的特性，在肛门外括约肌浅层"Y"形薄弱区下端形成无弹性的横闸，当干硬粪团通过肛管时，此薄弱区容易破裂而出现裂口，裂口久不愈合形成慢性溃疡。
4、外伤学说—肛门狭小学说：大多数学者认为干硬粪团通过肛管时，易引起肛管撕裂，尤其是肛门先天性发育不良者，更易受到损伤。
以上几种学说的共同特点是与排出干硬粪便有关，又与局部解剖结构有明显的因果关系。可以说肛裂的发生是多种致病因素相互作用的结果。
对肛裂应提倡早期防治
有人一生不患肛裂，其经验在于保持大便软化，有按时排便的规律，无久蹲强努的不良习惯。这是预防肛裂的根本办法。早期初发肛裂有效可以经保守治疗而愈。
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